В соответствии с «Положением Главного управления по борьбе с коррупцией при Генеральном прокуроре Азербайджанской Республики» Главное управление выполняет следующие обязанности и права:
 
Обязанности: 
- рассматривает и исследует полученную информацию о коррупционных правонарушениях;
- возбуждает уголовное дело и ведет предварительное расследование коррупционных преступлений;
- осуществляет розыскные операции с целью предотвращения, выявления и раскрытия коррупционных преступлений, контролирует исполнение законов в этой сфере при осуществлении оперативно-розыскных мероприятий по коррупционным преступлениям иными  субъектами оперативно-розыскной деятельности на основании письменного поручения Главного управления;
- принимает предусмотренные законом меры по возмещению материального ущерба, причиненного коррупционными преступлениями, а также по обеспечению конфискации имущества, которое может быть применено;
- изучает состояние борьбы с коррупцией, собирает, анализирует, обобщает информацию о преступлениях, связанных с коррупцией, и готовит предложения и рекомендации по повышению эффективности борьбы с коррупцией, если при осуществлении такой деятельности в нормативных правовых актах и их проектах выявляются обстоятельства, создающие условия для совершения коррупционных правонарушений, то ставит вопрос перед Генеральным прокурором для их устранения;
- обеспечивает принятие мер по обеспечению безопасности свидетелей, потерпевших, осужденных и других лиц, участвующих в уголовном процессе при предварительном расследовании коррупционных преступлений, а также при рассмотрении таких дел;
- обеспечивает конфиденциальность лица, сообщающего информацию о коррупционных правонарушениях в соответствии с Законом Азербайджанской Республики «О борьбе с коррупцией»;
- через Генерального прокурора регулярно информирует Президента Азербайджанской Республики и Комиссию по борьбе с коррупцией Азербайджанской Республики о мерах, принимаемых в области борьбы с коррупцией;
- сотрудничает с государственными структурами и другими ведомствами в борьбе с коррупцией;
- организует ведение электронной централизованной статистики преступлений, связанных с легализацией денег или иного имущества, полученных преступным путем, и финансированием терроризма, обеспечивает работу информационной системы для сбора, обработки и передачи статистических данных по этим преступлениям;
- предусмотренную пунктом 5.8-1 настоящего Положения статистическую информацию:
•    в целях надзора за соблюдением требований Закона Азербайджанской Республики «О борьбе против легализации денежных средств или иного имущества, приобретенных преступных путем, и финансирования терроризма» от 4 марта 2016 года, а также для оценки рисков в сфере легализации денег или иного имущества, полученных преступным путем, и финансирования терроризма предоставляет в органы надзора, установленные настоящим Законом;
•    наряду с целями, предусмотренными подпунктом 5.8-2.1 настоящего Положения, в целях обеспечения участия в формировании государственной политики в области противодействия легализации денежных средств или иного имущества, приобретенного преступным путем, и финансированию терроризма, предоставляет в Службу финансового мониторинга Азербайджанской Республики. 
- обеспечивает принятие мер по обеспечению безопасности сотрудников Главного управления и их близких родственников;
- информирует общественность о мерах, принимаемых в сфере противодействия коррупции, и обеспечивает прозрачность своей деятельности;
- осуществляет просветительские и профилактические мероприятия в сфере противодействия коррупции.
 
Права:
- в случаях и в порядке, установленных законодательством запрашивает и получает информацию, документы и другие материалы от физических и юридических лиц, государственных органов и их должностных лиц; в соответствии с Законом Азербайджанской Республики «О Государственном реестре недвижимости» представляет обоснованные письменные запросы о получении сведений из Государственного реестра недвижимости;
- проводит предварительную проверку полученной информации о коррупционных правонарушениях, получает объяснения, при необходимости принимает меры по проведению проверок, инвентаризаций, экспертиз и других проверок в организациях в порядке, установленном законодательством;
- осуществляет следственные и иные процессуальные действия по уголовным делам в пределах своей компетенции;
- проводит все розыскные мероприятия, предусмотренные статьей 10 Закона Азербайджанской Республики «О оперативно-розыскной деятельности», с целью предотвращения, выявления и раскрытия преступлений коррупционного характера в соответствии с настоящим Законом; при необходимости поручает иным субъектам оперативно-розыскной деятельности проводить оперативно-розыскные мероприятия в данной сфере и получает информацию о принятых мерах;
- применяет меры прокурорского реагирования, предусмотренные Законом Азербайджанской Республики «О прокуратуре», для устранения обстоятельств, создающих условия для совершения правонарушений, связанных с коррупцией;
- если правонарушения, связанные с коррупцией, не влекут за собой уголовную ответственность, направляет информацию об этих правонарушениях и их исполнителях в соответствующие государственные органы, органы местного самоуправления, публичные юридические лица и Комиссию по борьбе с коррупцией Азербайджанской Республики;
- сотрудничает с антикоррупционными и правоохранительными органами других стран, работает над развитием международного сотрудничества в сфере противодействия коррупции, изучает международный опыт в сфере противодействия коррупции и вносит предложения по применению эффективных методов и инструментов в этой сфере;
- с целью повышения эффективности борьбы с коррупцией готовит предложения и рекомендации по устранению причин и условий, способствующих коррупции, а также выявленных недостатков в этой сфере;
- вносит предложения по совершенствованию антикоррупционного законодательства;
- обеспечивает принятие мер по защите рабочих мест и технических помещений, расположенных в Главном управлении, от утечки информации, а также по обнаружению и нейтрализации средств извлечения данных;
- обеспечивает работников Главного управления служебным оружием, боеприпасами, техническими средствами и другим необходимым оборудованием, принимает меры по их охране;
- осуществляет просветительскую деятельность в сфере противодействия коррупции, продвигает законодательство, участвует в разработке и реализации мер и программ, связанных с вопросами по борьбе с коррупцией;
- сотрудничает с международными организациями, неправительственными организациями, средствами массовой информации, специалистами в области противодействия коррупции и привлекает их к осуществлению аналитической и информационной работы;
- осуществляет другие права, предусмотренные законодательством.