Главное управление по борьбе с коррупцией при Генеральном прокуроре Азербайджанской Республики было учреждено Распоряжением Президента Азербайджанской Республики № 114 от 3 марта 2004 года.
Главное управление является специализированным органом в области предварительного расследования коррупционных преступлений, и подчиняется Генеральному прокурору Азербайджанской Республики.
Основные обязанности Главного управления: рассматривать и расследовать сообщения о коррупционных правонарушениях; возбуждать уголовные дела и проводить предварительное расследование коррупционных преступлений; проводить розыскные операции с целью предотвращения, выявления и раскрытия коррупционных преступлений; осуществлять надзор за исполнением законов в этой сфере при проведении иными субъектами оперативно-розыскной деятельности оперативно-розыскных мероприятий по коррупционным преступлениям на основании письменного поручения Управления; принимать предусмотренные законом меры по возмещению материального ущерба, причиненного в результате коррупционных преступлений, а также обеспечивать конфискацию имущества, которое может быть применено; изучать состояние борьбы с коррупцией, собирать, анализировать, обобщать информацию о правонарушениях, связанных с коррупцией, и готовить предложения и рекомендации по повышению эффективности борьбы с коррупцией; обеспечить принятие мер по обеспечению безопасности свидетелей, потерпевших, обвиняемых и других лиц, участвующих в уголовном процессе, при предварительном расследовании коррупционных преступлений, а также при рассмотрении таких дел; посредством Генерального прокурора регулярно информировать Президента Азербайджанской Республики и Комиссию по борьбе с коррупцией о мерах, принимаемых в области противодействия коррупции; сотрудничать с государственными органами и другими органами в сфере противодействия коррупции, информировать общественность о предпринимаемых мерах и обеспечивать прозрачность своей деятельности и т.п.