Следственное управление является независимым структурным подразделением Генеральной Прокуратуры Азербайджанской Республики.
Основные обязанности и функции Управления за исключением преступлений, совершенных на оккупированных Республикой Армения территориях Азербайджанской Республики, тяжких и особо тяжких преступлений против мира и человечности, государственной власти, против личности, совершенных в экономической или иных сферах, коррупционных и иных преступлений против служебных интересов, включают проведение предварительного расследования преступлений по поручению Генерального прокурора Азербайджанской Республики или его первого заместителя, преступлений, совершенных сотрудниками органов прокуратуры, преступлений, совершенных при условиях неочевидности, преступлений затрагивающих общественные отношения, которые отличаются своей актуальностью в обществе, а также преступлений, подпадающих под территорию или подсудность нескольких прокуратур или правоохранительных органов, просматривать информацию о готовящихся или совершенных преступлениях, с целью проведения оперативно-розыскных мер давать указания субъектам оперативно-розыскной деятельности и т.д.